Les quelques inventaires effectués dans cette région ont permis de recenser soixante neuf espèces de reptiles, y compris quelques espèces endémiques à Masoala.

Les caméléons sont réputés surtout pour trois caractéristiques. Tout d'abord, ils sont capables de bouger chaque œil indépendamment l'un de l'autre et peuvent regarder dans toutes les directions sans bouger la tête. Ce système de vision très particulier leur permet de viser avec précision la proie qu'ils comptent attraper avec leur très longues langues, parfois plus grandes que le corps même du caméléon. Mais leur " spécialité " est bien leur capacité à changer de couleur, ceci aussi bien dans un but de camouflage que parfois comme " langage " lors d'échanges sociaux (affrontement et parades nuptiales).

Les serpents sont aussi représentés mais ils sont tous aussi inoffensifs que ce boa malgache qui étouffe ses proies .

Le genre Phelsuma comprend les geckos diurnes emblématiques de Madagascar. Ces geckos sont généralement reconnaissables à leurs teintes vertes et aux taches rouges présentes sur le corps.