Le gestion du réseau national des aires protégées de Madagascar est confiée à l'Association Nationale pour la Gestion des Aires Protégées (A.N.G.A.P). L'ANGAP en tant qu'association privée est sous la tutelle du Ministère de
l' Environnement, Eaux et Forêts et elle a pour mission "d'établir, conserver et gérer de manière durable un réseau de parcs et réserves représentatifs de la diversité géologique et du patrimoine naturel et culturel propre à Madagascar".

Les pressions sur le milieu naturel de Madagascar sont entre les plus élevées au monde. Il reste aujourd'hui 15,2% seulement de forêts qui recouvraient le pays lors de l'arrivée des premiers habitants humains il y a deux mille ans. Au moins 15 espèces de lémuriens ainsi que des douzaines d'autres espèces ont disparu depuis l'arrivée de l'homme.

C'est dans ce contexte que le Gouvernement de Madagascar, en mars 1997, a décrété la création du Parc National Masoala.